เพื่อรักษาผลงานที่ดีที่สุด FFU ต้องการการบํารุงรักษาและทําความสะอาดเป็นประจําการบํารุงรักษาเป็นประจําเป็นสิ่งจําเป็นในการรักษา FFU ให้ทํางานได้อย่างมีประสิทธิภาพ และป้องกันการปนเปื้อนจากการสร้างขึ้นในกรอง.

การบํารุงรักษาที่แนะนําสําหรับ FFU ประกอบด้วยการเปลี่ยนเครื่องกรองทุกหกเดือน การทําความสะอาดใบลมทุกเดือน และการรับรองว่าหน่วยทํางานด้วยความเร็วที่ถูกต้องการไม่บํารุงรักษาเป็นประจํา อาจทําให้ประสิทธิภาพของกรองลดลงอย่างมาก และเพิ่มความเสี่ยงของการติดเชื้อในห้องสะอาด.

FFU เป็นสิ่งจําเป็นในการรักษาสภาพแวดล้อมที่ควบคุมและ sterile ในห้องสะอาด โดยไม่มี FFU สารปนเปื้อนในอากาศ เช่นฝุ่น แบคทีเรียและฟองจะสะสมส่งผลให้เกิดการปนเปื้อนของผลิต และผลผลิตที่ลดลง.

นอกจากการป้องกันการปนเปื้อนแล้ว FFU ยังให้สภาพแวดล้อมความดันบวก เพื่อให้แน่ใจว่าอากาศในห้องสะอาดถูกนําออกไปจากจุดเข้าความดันบวกสร้างอุปสรรคที่ป้องกันสารพิษจากการเข้าไปในห้องสะอาด, การันตีว่ากระบวนการผลิตไม่ถูกหยุด