ตู้คลีนรูมโดยทั่วไปสร้างจากวัสดุที่ทำความสะอาดง่ายและไม่ทำปฏิกิริยากับสารเคมีเหล็กกล้าไร้สนิมมักเป็นวัสดุที่เลือกใช้สำหรับตู้คลีนรูม เนื่องจากมีความทนทานและง่ายต่อการปลอดเชื้อ

วัสดุอื่นๆ ที่อาจใช้ ได้แก่ พลาสติก อะลูมิเนียม และวัสดุอื่นๆ ที่ไม่เกิดปฏิกิริยาโดยทั่วไปแล้ว การสร้างตู้คลีนรูมได้รับการออกแบบให้มีจำนวนตะเข็บและรอยต่อน้อยที่สุด ซึ่งสามารถดักจับฝุ่นและสิ่งปนเปื้อนอื่นๆ

ตู้คลีนรูมได้รับการออกแบบให้เป็นไปตามมาตรฐานความปลอดภัยต่างๆ เช่น ที่กำหนดโดยองค์การมาตรฐานระหว่างประเทศ (ISO) และสมาคมป้องกันอัคคีภัยแห่งชาติ (NFPA)

มีตู้คลีนรูมหลายประเภทให้เลือก แต่ละประเภทได้รับการออกแบบเพื่อตอบสนองความต้องการและข้อกำหนดเฉพาะ

ตู้ติดผนังติดตั้งบนผนังห้องคลีนรูมและออกแบบมาเพื่อประหยัดพื้นที่ตู้เหล่านี้มักทำจากสแตนเลสหรือวัสดุที่ไม่เกิดปฏิกิริยาอื่นๆ

ตู้ตั้งพื้นเป็นตู้แบบสแตนด์อโลนที่สามารถวางไว้ที่ใดก็ได้ในห้องคลีนรูมมักใช้สำหรับจัดเก็บหรือเป็นเวิร์กสเตชัน

ตู้คลีนรูมเคลื่อนที่ได้รับการออกแบบให้เคลื่อนย้ายจากที่หนึ่งไปอีกที่หนึ่งมักใช้สำหรับขนส่งหรือจัดเก็บอุปกรณ์และวัสดุสิ้นเปลือง